肝穿是一种有创性的检查，所以会造成不舒适，比如针穿刺的时候有疼痛，然后有小血管的出血。实际上只有在经皮穿刺的时候有疼痛，进入肝脏后不会很疼，因为肝脏里面没有神经，只有肝包膜外面有神经。所以如果是出血量比较大的情况下，只会有憋胀感，而疼痛感不强。现在穿刺的技术越来越好，穿刺时都会做针道麻醉，所以肝穿不是很疼。出血的风险也不是很高，因为肝穿现在都是在彩超引导下进行，看得很清楚，有血管穿刺能避开。
所以肝穿的副作用，实际上有时候是病人本身的心理带来的，病人一直感觉不舒服，本身没有很大的副作用。肝穿副作用发生率很低，只有0.01%~0.3%左右，最主要的副作用是局部出血，但是在彩超引导下是可以避免的。
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